Identificación de nuevos genes de fusión y su relevancia clínica en el cáncer de endometrio
El cáncer de endometrio (CE) es una de las neoplasias ginecológicas más prevalentes en países desarrollados y en desarrollo, con una incidencia en constante aumento en los últimos años. Su patogénesis está influenciada por factores como la exposición a estrógenos, alteraciones en el sistema de reparación de errores de apareamiento del ADN, mutaciones genéticas y metilación aberrante de ADN y microARN. A pesar de estos factores, los mecanismos moleculares subyacentes siguen siendo poco comprendidos, lo que dificulta su manejo terapéutico. Los genes de fusión, resultantes de reordenamientos cromosómicos o transcripción anormal, han surgido como elementos críticos en la tumorigénesis, el pronóstico y la resistencia a fármacos en múltiples neoplasias. Sin embargo, su estudio en el CE es limitado.
Este estudio tuvo como objetivo identificar nuevos genes de fusión en CE y evaluar su relevancia clínica. Se incluyeron 28 pacientes diagnosticadas con CE, empleándose secuenciación de ARN para analizar genomas y transcriptomas completos. Mediante las herramientas STAR-comparison y STAR-fusion, se identificaron genes de fusión, mientras que su asociación clínica se analizó con pruebas de chi-cuadrado y t de Student. Los resultados demostraron la presencia de genes de fusión en todas las pacientes, con un rango de 3 a 110 fusiones por caso, incluyendo combinaciones de ARNm-ARNm, ARNnc-ARNnc y ARNnc-ARNm.
Se identificaron seis genes de fusión con alta frecuencia: RP11–123O10.4–GRIP1 (89.28%), RP11–444D3.1–SOX5 (60.71%), RP11–680G10.1–GSE1 (50.00%), NRIP1–AF127936.7 (42.86%), RP11–96H19.1–RP11–446N19.1 (39.29%) y DPH7–PTP4A3 (32.29%). Las lecturas medias de unión fueron 16.36, 4.71, 7.04, 1.14, 3.25 y 10.82, respectivamente.
Al analizar su relación con características clínicas, NRIP1–AF127936.7 y DPH7–PTP4A3 se detectaron exclusivamente en pacientes con estadio III, sugiriendo un papel en la progresión tumoral. DPH7–PTP4A3 también se asoció con tumores grado 2-3 y recidivas, indicando su relación con agresividad y mal pronóstico. En contraste, RP11–123O10.4–GRIP1, RP11–444D3.1–SOX5, RP11–680G10.1–GSE1 y RP11–96H19.1–RP11–446N19.1 estuvieron presentes en todos los estadios, sugiriendo participación en la tumorigénesis inicial.
La función biológica de estos genes requiere mayor exploración. Por ejemplo, GRIP1, componente de RP11–123O10.4–GRIP1, regula la actividad transcripcional de receptores nucleares y la proliferación celular. SOX5, en RP11–444D3.1–SOX5, está implicado en transición epitelio-mesénquima y metástasis. GSE1, en RP11–680G10.1–GSE1, promueve proliferación e invasión en cáncer de mama. PTP4A3, en DPH7–PTP4A3, favorece migración celular en cáncer colorrectal.
Estos hallazgos subrayan el potencial de los genes de fusión como biomarcadores diagnósticos, pronósticos y dianas terapéuticas en CE. Futuros estudios deben dilucidar sus mecanismos funcionales y validar su utilidad clínica.
doi.org/10.1097/CM9.0000000000000203