Fenotipos de alto riesgo de enfermedades genéticas en una población de la Unidad de Cuidados Intensivos Neonatales
Las enfermedades genéticas son una causa significativa de mortalidad y morbilidad infantil, representando el 35% de las muertes durante el primer año de vida. El diagnóstico e intervención tempranos son cruciales, ya que más del 25% de los neonatos con diagnósticos genéticos pueden curarse si se identifican oportunamente. Sin embargo, el proceso diagnóstico de enfermedades genéticas en neonatos suele ser prolongado y costoso, especialmente en aquellos sin fenotipos típicos, como características faciales distintivas o anomalías congénitas múltiples (ACM). Este estudio busca identificar fenotipos de alto riesgo indicativos de enfermedades genéticas en una población de la Unidad de Cuidados Intensivos Neonatales (UCIN), utilizando una herramienta innovadora, el pipeline Auto-Neo-HPO, para analizar datos de registros médicos electrónicos (RME).
El estudio se realizó en una UCIN terciaria del Hospital Infantil de la Universidad de Fudan, Shanghai, China, entre el 1 de junio de 2016 y el 30 de junio de 2020. Los criterios de inclusión fueron neonatos con edad posnatal menor a 28 días, edad gestacional superior a 35 semanas, estancia hospitalaria de al menos 24 horas y consentimiento informado de los padres o tutores. Se excluyeron neonatos con ACM o información clínica ausente o de baja calidad. Se utilizaron datos de RME y secuenciación clínica del exoma para evaluar características demográficas, edad gestacional, peso al nacer, fenotipos al alta y resultados.
El pipeline Auto-Neo-HPO se desarrolló para extraer y normalizar hallazgos clínicos de los RME mediante la Ontología de Fenotipo Humano (HPO). Esta herramienta incluye una base de datos semántica en chino e inglés y un procesamiento del lenguaje natural para convertir términos no coincidentes en términos HPO. Dos genetistas y dos neonatólogos validaron y actualizaron los resultados para garantizar precisión. El rendimiento del pipeline se verificó, y los términos HPO se ajustaron para reflejar condiciones fenotípicas específicas de neonatos.
Se incluyeron 2.600 neonatos, 248 (9,5%) con diagnósticos genéticos. La población consistió en 1.554 varones (59,8%) y 1.046 mujeres (40,2%). Entre los participantes, 168 (6,5%) fallecieron o recibieron cuidados paliativos, incluyendo 33 (13,3%) con diagnósticos genéticos y 135 (5,7%) sin estos. Los fenotipos más frecuentes fueron morfología cardiaca anormal (49,2%), ictericia (47,3%) y sepsis (42,3%).
Se identificaron tres fenotipos de alto riesgo asociados a diagnósticos genéticos: hipotonía muscular (OR ajustada: 3,41), convulsiones (OR ajustada: 2,47) y criptorquidia (OR ajustada: 3,36). En contraste, la ictericia (OR: 0,57) y la meningitis (OR: 0,17) se clasificaron como fenotipos de bajo riesgo. La alteración metabólica/homeostásica no mostró diferencias significativas, aunque condiciones como hiperinsulinemia y aciduria glutárica se asociaron fuertemente con diagnósticos genéticos en la práctica clínica.
Los desafíos incluyeron la variabilidad en el mapeo de términos clínicos a HPO. Por ejemplo, distintos tipos de cardiopatías congénitas se agruparon bajo «morfología cardiaca anormal», excepto el ductus arteriosus persistente. Las limitaciones fueron la falta de descripción de la severidad fenotípica en HPO, términos clínicos no mapeables y la omisión de la edad de inicio de los fenotipos.
En conclusión, el pipeline Auto-Neo-HPO identificó fenotipos de alto riesgo para enfermedades genéticas en neonatos de UCIN. La hipotonía muscular, convulsiones y criptorquidia son indicadores clave para pruebas genéticas adicionales. Estos hallazgos son relevantes para el diagnóstico temprano, especialmente en entornos con recursos limitados.
doi.org/10.1097/CM9.0000000000001959